我国农业部已于2000年12月22日发布，2001年4月1日实施了《根瘤菌肥料》(rhizobium-fertilizer)的中华人民共和国农业行业标准，编号为NY410-2000。此标准在原有标准NY27-1994《微生物肥料》的基础上，对其中的根瘤菌肥料部分进行修改。此标准规定了豆科根瘤菌肥料的分类、技术要求、检验方法、检验规则、标志、包装、运输及储存。此标准适用于以共生固氮性能优良的根瘤菌菌株为生产用菌，经液体发酵生产而成的根瘤菌液体肥料，菌液以持水性能良好的载体为吸附剂制成的根瘤菌固体肥料；也适用于以根瘤菌为主的含有能促进结瘤、固氮作用的芽孢杆菌、假单胞菌或其他有益的促生细菌制成的复合根瘤菌肥料。复合根瘤菌肥料是指以根瘤菌为主，加入少量能促进结瘤、固氮作用的芽孢杆菌、假单胞细菌或其他有益的促生微生物的根瘤菌肥料。加入的促生微生物必须是对人畜及植物无害的菌种。根瘤菌肥料和复合根瘤菌肥料产品按寄主种类的不同，分为菜豆根瘤菌肥料、大豆根瘤菌肥料、花生根瘤菌肥料、三叶草根瘤菌肥料、豌豆根瘤菌肥料、苜蓿根瘤菌肥料、百脉根根瘤菌肥料、紫云英根瘤菌肥料和沙打旺根瘤菌肥料等。
 标准规定用于生产根瘤菌肥料的菌种必须是经过签定的菌株，或有两年多点田间试验并获得显著增产的菌株。该菌种必须在菌肥生产前一年内经无氮营养液盆栽接种试验鉴定，结瘤固氮性能优良，接种植株干重比对照显著增加。